依我國關稅法第67條規定，採取特別防衛措施，得對特定進口貨物提高關稅、設定「關稅配額」或徵收「額外關稅」。第4條並規定，海關進口稅則得針對特定進口貨物，就不同數量訂定其應適用之關稅稅率，實施「關稅配額」。

我國配合加入WTO，公告自91年1月1日起對三類貨品實施「關稅配額」制度，包括：小汽車及其底盤、紅豆等17種及雞肉等7種食品。另外自92年1月1日起增加稻米（四類均不包括大陸物品）。

實施關稅配額之進口貨物，在訂定數量內者適用「較低關稅稅率」（配額內稅率），超過數量部分，適用「一般關稅稅率」（配額外稅率），例如由日本進口小汽車，92年配額為12,000輛，進口量在12,000輛以內者適用「配額內稅率29%」，超過12,000輛者適用「配額外稅率60%」。

進口關稅配額貨物之核配方式有兩種，分別介紹如下：

一、先到先配：若進口美國、加拿大、歐盟產製之小汽車及其底盤，不必事先申請。由海關利用進口報單通關時，以進口日之先後順序核配。進口數量達配額之95%時，關稅總局應公告，並俟分配作業完成再徵稅驗放。同一進口日報關總數超過未使用數量時，按個別申報數量之比例核配。進口人未自進口日起15日內報關時，數量已核配完畢者，不得要求適用配額內稅率課稅。

二、事先核配：若進口美國、加拿大、歐盟以外之WTO會員製造之小汽車及其底盤，應於進口前向「國貿局」申請，取得「配額證明書」。進口紅豆等17種食品、食米等，應於進口前向「中信局」標購，支付「權利金」，取得「配額證明書」。進口雞肉等7種食品，應於進口前向「中信局」申請核配，繳交「履約保證金」，取得「配額證明書」。「事先核配所獲配額」，得於證明書有效期限內全部或部分轉讓，並應於有效期限內整批或分批進口。「履約保證金」於有效期限內全數進口後，向「中信局」申請發還。

「進口關稅配額貨物」報關時，應依稅則第98章申報稅號，其貨物不得以C1通關。如屬「事先配額貨物」未及檢附證明書者，應申報一般稅則，依「配額外稅率」通關；或於海關放行前申請退運出口或依關稅法第52條及保稅倉庫設立及管理辦法規定申請「存儲保稅倉庫」。另外進口農產品原料型態混合物，如紅豆、花生……合計重量超過20%或稻米達10%時，應重新分項申報。